南宋初，左、右仆射(púyè)加同平章事，为正宰相，不再兼任二省侍郎，两省侍郎改为参知政事。南宋孝宗以后，正宰相为左右丞相，副宰相仍为参知政事。此外，宁宗、理宗都曾设“平章军国重事”和“同平章军国重事”，由老臣或权臣担任，处理军国大事，权位高于宰相。
元朝以中书省为政务中枢，主官中书令常由皇太子兼领，下为左右丞相，再下为平章政事，副职为左右丞及参知政事。
明朝初设中书省，左右丞相。1380年，朱元璋罢中书省，废丞相，由皇帝亲决国政。宰相制度遂废。后皇帝以不胜庶政之繁，设内阁大学士协理文书。后阁职渐重，大学士成为事实上的“宰相”，称辅臣，居首者为首辅。
清朝沿明制，雍正时设军机处，成为事实上的宰相。明、清习惯上都称授大学士为拜相，但无正式宰相名份。
在所有的官职中，宰相的变化最多，这是由于君主既需要宰相帮助办理政事，又担心宰相的权位过重，危及自身的权力。