随着执政时间的延长，纳赛尔的野心膨胀，他在党政军机构中肆意扩大私人势力，企图独揽大权，引起了他与社会党总书记伊斯梅尔和其他党政领导人之间的严重矛盾。同年12月，总统委员会被撤销，建立最高人民委员会主席团，伊斯梅尔被推选为主席团主席，纳赛尔任副主席。这一明显削弱纳赛尔地位的做法，引起了他的强烈不满。1980年4月，纳赛尔联合国防部长安塔尔等人逼迫伊斯梅尔辞去社会党总书记和最高人民委员会主席的职务，并把他流放到苏联。纳赛尔接任党的总书记和主席团主席的职务，仍担任总理，一跃而成为民主也门的最高执政者。
此外，阿里·纳赛尔对民主也门发展道路和方针作出了较大的变革，虽然他仍表示坚持社会主义道路，但却强调实行经济多样化的灵活政策，允许放宽对私营企业活动的限制，还主张增加与西方国家的经济往来，强调改善与邻国君主政权的关系，以建立一个和平的外部环境。阿里·纳赛尔的这一系列言行，被党内激进派斥之为右倾思想，苏联人也批评纳赛尔的“右倾路线”。纳赛尔即表示反对苏联对民主也门的粗暴干涉，发表了“要苏联人作朋友，不要他们做主人”的谈话。